Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sec22bO08547 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms