Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2al1oL7MU04 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms