Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Gm20795J3QP49 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Gm20795J3QP49 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gm20795J3QP49 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gm20795J3QP49 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm20795J3QP49 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm20795J3QP49 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm20795J3QP49 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm20795J3QP49 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gm20795J3QP49 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Gm20795J3QP49 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20795J3QP49 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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