Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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