Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm20918J3QN17 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm20918J3QN17 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm20918J3QN17 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm20918J3QN17 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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