Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms