Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r12G5E8G1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms