Protein–RNA interactions for Protein: G3X9B4

4933408B17Rik, MCG121508, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933408B17RikG3X9B4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933408B17RikG3X9B4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms