Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan2G3X952 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan2G3X952 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms