Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm17455G3UW87 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm17455G3UW87 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm17455G3UW87 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm17455G3UW87 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm17455G3UW87 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17455G3UW87 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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