Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms