Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Cdh18E9Q9Q6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Cdh18E9Q9Q6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Cdh18E9Q9Q6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Cdh18E9Q9Q6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Cdh18E9Q9Q6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Cdh18E9Q9Q6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Cdh18E9Q9Q6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms