Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp31E9Q6Y8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp31E9Q6Y8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms