Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms