Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms