Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Zfp558E9Q1J0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Zfp558E9Q1J0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Zfp558E9Q1J0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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