Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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