Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ddx60E9PZQ1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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