Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sfta2E9PXB6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms