Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms