Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc175E9PVB3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms