Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc6D3YZP9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms