Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms