Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SafbD3YXK2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SafbD3YXK2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms