Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Polr3aB2RXC6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr3aB2RXC6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms