Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms