Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms