Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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