Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cavin4A2AMM0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cavin4A2AMM0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms