Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fbxo47A2A6H3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms