Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ccdc18Q640L5 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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