Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Shank3Q4ACU6 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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