Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TtrP07309 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms