Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Vegfa-203ENSMUST00000113519 513 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm12192-201ENSMUST00000120146 487 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm39121-201ENSMUST00000208847 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 CT025533.1-201ENSMUST00000227485 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 AC102815.2-201ENSMUST00000227837 541 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Ankmy1-201ENSMUST00000112998 3243 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm16485-201ENSMUST00000104915 3983 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Snx25-207ENSMUST00000170416 3067 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Pfkm-202ENSMUST00000163507 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Ick-204ENSMUST00000118869 2540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Abcd3-204ENSMUST00000197383 3156 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Metap2-210ENSMUST00000181217 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Rpl7l1-ps1-201ENSMUST00000118822 725 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm11223-201ENSMUST00000120560 450 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Tpsab1-202ENSMUST00000153118 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm22667-201ENSMUST00000158718 328 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Olfr545-201ENSMUST00000058750 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Dag1-202ENSMUST00000166905 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Sept2-215ENSMUST00000179353 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Rnf185-202ENSMUST00000077078 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Nuggc-202ENSMUST00000150897 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Pparg-201ENSMUST00000000450 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Wdr27-201ENSMUST00000170386 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Trav9n-4-201ENSMUST00000103626 595 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm24433-201ENSMUST00000104080 133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm11239-202ENSMUST00000179977 1080 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Cox19-207ENSMUST00000198966 475 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm15738-205ENSMUST00000210378 1051 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Wdr61-202ENSMUST00000118771 3372 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Samhd1-201ENSMUST00000057725 3926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Zmym6-202ENSMUST00000094713 3922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms