Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms