Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm12758-201ENSMUST00000127010 4175 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Lin7a-201ENSMUST00000020057 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Cnr2-201ENSMUST00000068830 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Cd22-210ENSMUST00000189718 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Hnrnpc-205ENSMUST00000227242 2617 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Ipo11-202ENSMUST00000080856 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Slc2a5-201ENSMUST00000030826 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Arhgdib-203ENSMUST00000111892 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm27651-201ENSMUST00000183465 246 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 5031434C07Rik-201ENSMUST00000053559 2894 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Ufm1-203ENSMUST00000146598 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Adgrl3-209ENSMUST00000119385 4905 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm35572-201ENSMUST00000212427 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm35934-201ENSMUST00000213002 2494 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm8173-201ENSMUST00000186797 1977 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Ube2k-207ENSMUST00000202082 4506 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Eif4e2-201ENSMUST00000050876 2869 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Frk-201ENSMUST00000019913 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Wdcp-206ENSMUST00000223551 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 4930433I11Rik-202ENSMUST00000206529 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Cdh18-203ENSMUST00000164787 2744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm10619-202ENSMUST00000186073 3287 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm11604-201ENSMUST00000121487 742 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm16008-201ENSMUST00000126009 810 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Olfr1381-201ENSMUST00000167248 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm29068-201ENSMUST00000191607 400 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms