Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms