Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NischQ80TM9 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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