Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Trim12aQ99PQ1 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Trim12aQ99PQ1 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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Trim12aQ99PQ1 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Trim12aQ99PQ1 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Trim12aQ99PQ1 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Trim12aQ99PQ1 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Trim12aQ99PQ1 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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Trim12aQ99PQ1 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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