Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms