Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Zzef1Q5SSH7 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms