Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Hoxd10P28359 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Hoxd10P28359 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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Hoxd10P28359 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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