Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm28508-201ENSMUST00000188016 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm37282-201ENSMUST00000191987 164 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm37665-201ENSMUST00000192353 149 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm43835-201ENSMUST00000195932 149 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm43535-201ENSMUST00000197846 164 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm44379-201ENSMUST00000204501 164 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm44268-201ENSMUST00000204814 164 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 AC142227.1-201ENSMUST00000221371 621 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Tmcc3-202ENSMUST00000117460 3217 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Itm2a-201ENSMUST00000033591 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Olfr411-203ENSMUST00000214769 2545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Ppp2r2b-201ENSMUST00000025377 2031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Zmym6-202ENSMUST00000094713 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm45294-201ENSMUST00000210685 2102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Mpp2-202ENSMUST00000100398 3577 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Anxa10-201ENSMUST00000034052 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Adgrl3-219ENSMUST00000122356 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gramd1b-203ENSMUST00000119373 3857 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Cdh1-201ENSMUST00000000312 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Tdrd3-205ENSMUST00000170865 2530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Pcdhb6-201ENSMUST00000061717 3729 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Ccnd1-201ENSMUST00000093962 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Adam9-201ENSMUST00000084032 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Serpina3n-201ENSMUST00000021506 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Nrip3-202ENSMUST00000041460 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Hdac7-204ENSMUST00000116409 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Usp28-201ENSMUST00000047349 4133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Polr3k-201ENSMUST00000039551 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm43910-201ENSMUST00000204561 3241 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Tgm4-201ENSMUST00000026893 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Ebf2-201ENSMUST00000022637 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Pcdhb4-201ENSMUST00000056712 3718 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 n-R5s165-201ENSMUST00000104074 100 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm13719-201ENSMUST00000122018 2111 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm37942-201ENSMUST00000191875 628 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm38086-201ENSMUST00000193543 434 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxb4P10284 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms