Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms