Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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