Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms