Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Zfp180-202ENSMUST00000203854 3845 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Cnpy1-203ENSMUST00000120068 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr1564-203ENSMUST00000213642 5271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr1564-205ENSMUST00000215450 5281 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm11676-201ENSMUST00000120443 490 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm12841-201ENSMUST00000128263 338 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm43934-201ENSMUST00000205095 388 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm33115-202ENSMUST00000223487 703 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr90-201ENSMUST00000070808 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Kprp-201ENSMUST00000072363 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ppil4-201ENSMUST00000015901 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Cntn4-205ENSMUST00000113261 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ston2-203ENSMUST00000164713 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm42444-201ENSMUST00000199366 4558 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Krt222-201ENSMUST00000038214 2042 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr214-205ENSMUST00000217313 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm37039-201ENSMUST00000193733 2485 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ctnna3-203ENSMUST00000105441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 CT025645.1-201ENSMUST00000222760 4322 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Arhgef7-202ENSMUST00000074856 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ifit1bl1-201ENSMUST00000112467 2193 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Phf21a-208ENSMUST00000111294 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Lif-202ENSMUST00000066283 4026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Mfsd8-201ENSMUST00000026859 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Ccdc116-201ENSMUST00000023452 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Serpina3k-201ENSMUST00000043058 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Acp1-201ENSMUST00000062740 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Lrrc55-202ENSMUST00000111601 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Gm38252-201ENSMUST00000192701 2616 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Itm2a-201ENSMUST00000033591 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms