Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms