Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms