Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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